「ゲノム（genome）」とは"gene（遺伝子）"と集合をあらわす"-ome"を組み合わせた言葉で、生物のもつ遺伝子（遺伝情報）の全体を指す言葉です。その実体は生物の細胞内にあるDNA分子であり、遺伝子や遺伝子の発現を制御する情報などが含まれています。タンパク質は、遺伝子の情報をもとに転写・翻訳という過程を経て作られます。

ゲノム研究に最適な研究機関向けワークステーション

　NVIDIA Parabricksの利用　

NVIDIA Parabricks は、計算生物学者や生物情報学者が毎日使用するツールの GPU 対応版を提供します。実行時間の大幅な短縮、ワークフローのスケーラビリティ、計算コストの削減を実現します。

ゲノム解析を高速化するNVIDIAのプラットフォーム

Parabricksは、GPUの特長である並列演算性能を活用して全ゲノム解析の一連の計算処理を超高速化するソフトウェアです。全ゲノム情報解析は、従来のスーパーコンピューターを用いると膨大な時間がかかる作業ですが、一般的なCPU環境で1サンプル当たり20時間以上を要するような計算処理をNVIDIA RTX6000 Ada2基と組み合わることで、短時間で完結することが可能です。さらに、最新バージョンでは正常細胞の全ゲノム解析だけでなく、がんを中心とする体細胞変異の全ゲノム解析についても一般的に用いられている数種類のプログラムを高速化実装しており、大規模ながん全ゲノム解析時代を先取りしています。

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本構成では、GPUを2枚搭載し、高速なモデルのCPU (AMD EPYC 9554) を使用しています。
電源ユニットは容量1600W (100V環境で約1200-1300W程度) の製品を採用しており、100V環境での利用が可能です。

ラックマウントレールキットと、縦置きのタワー筐体として利用する場合のフットスタンドでSSDは、ご指定の速度を満たすようにGen4対応のM.2スロットにGen4 NVMeを搭載しています。

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